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在混合类群中识别罕见细胞

在一个混合类群中识别和跟踪具有生理重要性的罕见细胞类型是一个挑战。这项研究(由Hans Clevers 和Alexander van Oudenaarden的实验室合作进行)通过对小鼠小肠细胞器采用“单细胞mRNA测序”方法来试图解决这一问题。

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作者建立了一个被称为RaceID的算法,该算法允许在由单一细胞组成的一个复杂类群中进行罕见细胞类型识别。


他们为小肠的罕见肠内分泌细胞定义了一个标记物。利用这一方法对来自小鼠原始小肠的细胞所做的分析显示,表达Lgr5的类群由一个同质干细胞类群组成,其中有少数罕见的分泌细胞,包括Paneth细胞。

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