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单分子测序技术受追捧 罗氏千万美元追投创业公司

位于西雅图的Stratos Genomics 公司是一家以基因测序技术为主导的创新公司。近日,该公司宣布,他们运用一种新型单分子检测方法来进行纳米孔测序。这种可对长片段DNA进行单分子检测的技术是建立在该公司之前已开发的碱基模板序列之上。该公司称:目前应用已有的Sequencing by Xpansion(SBX)技术,已开发出了一种低成本、更快速地进行全基因组测序的方法。

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新测序技术使得单分子的长序列可以通过孔径小、低成本的纳米孔检测设备,并且具有较高的信噪比,从而可以快速鉴定特定的碱基序列。该测序技术的一大亮点就是,采用了一种专有的DNA聚合酶来延伸核苷酸链。


2014年6月,罗氏公司对Stratos Genomics公司进行投资,除了推动单分子纳米孔DNA测序研发之外,还着手开发纳米孔蛋白测序。在过去的一年中,罗氏已经和Stratos公司携手开发低成本、快速DNA测序技术。罗氏擅长于聚合酶的突变技术、蛋白纳米孔的设计、修饰核苷酸以及稀有试剂的生产,为Stratos公司的研发工作给予了非常大的帮助。


罗氏测序业务部门副总裁兼项目负责人Vinod Makhijani表示:“这项测序技术具有里程碑意义,尽管这项技术投入到商业应用还有一些困难,但是我们坚信通过罗氏和Stratos的共同努力一定能够攻克这些困难。”


Stratos Genomics公司董事长兼首席科学家Mark Kokorois说:“一年前,我们设定了一个具有挑战性的目标,就是在今年6月前开发出应用X-NTP的测序技术,现在我们已经完成这一目标,目前正在专注于商业性能的优化。”


Stratos Genomics公司CEO Allan Stephan介绍到:“由于这一里程碑性的研发,罗氏风投和Fisk风投参与了去年的B轮融资。此次,罗氏将会再投资1千万美金,Fisk也将再投入5百万美金。本次融资的目标是3千万。公司希望使这种可扩展性的DNA测序技术成为一种成本更低、性能更优、速度更快的测序技术。


据悉,SBX代表的是一种全新的测序技术,它采用的是一种单分子的检测方法,克服了当前方法的局限性,能够进行低成本的,快速的全基因组测序。尽管目前市场上有其他的单分子测序公司,比如PacBio 和 Oxford Nanopore,但是Stratos公司的单分子技术有别于其他公司,并且在这一领域具有竞争优势。当前,运用最广泛的基因组测序技术是Ilumina公司的边合成边测序(SBS)。


边合成边测序需要首先扩增出一簇一致的DNA片段,在测序的过程中,每加入一个特定的碱基就会产生一种特异的荧光,并且需要大的设备。相比之下,SBX不需要预先扩增出一簇DNA,该方法将DNA转换成一个更大的‘替身’分子Xpandomers,再通过检测Xpandomers分子来测定原始的DNA序列。”


Stephan总结道:“这样就可以低成本、快速、更精准地进行全基因组测序,并且测序的价格也将会降到每个人可承受的范围之内。”


就像Stephan说的那样,单分子测序技术代表的是未来一种潜在的、颠覆性测序技术。

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