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最新埃博拉基因组测序结果

去年夏天西非埃博拉爆发的早期阶段,科学家们以空前的规模和速度测序了这种致命病毒的基因组,为人们揭示了许多疫情蔓延的关键信息,比如说病毒只通过人与人接触传播,病毒在多次传播中获得了许多新突变等等。

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虽然埃博拉爆发最糟糕的时期已经过去,但这场疫情并未结束,还有许多问题需要人们去解答。为此,哈佛大学、Broad研究所、美国疾控中心(CDC)、美国国家过敏和传染病研究所(NIAID)等研究机构测序了两百多个埃博拉病毒样本的基因组,进行了迄今为止最全面的分析。这项研究发表在六月十八日的Cell杂志上,展示了病毒在这么长时间里发生的改变。


“我们之前的工作反映了埃博拉爆发后三周的病毒行为,”文章的资深作者Sabeti说。“现在这项研究跟踪了病毒在七个月内的变化,有助于理解埃博拉的长期演化。”


“这些高分辨率的测序数据显示,在埃博拉疫情爆发的后期,病毒跨境传播是非常少的,”文章第一作者Danny Park指出。“这是一个重要的信息,因为塞拉利昂、利比里亚和几内亚(三个受疫情影响的主要国家)的国境被认为是千疮百孔的。”


跨境行为在埃博拉爆发初期推动了疫情的发展,但后来病毒并没有像人们预测的那样迁移,Park说。“在国境上实施的控制措施的确有效,这是令人欣慰的好消息,”他说。“人们也应当把关注国内的迁移行为。”


研究人员通过测序分析了埃博拉在持续性爆发中出现的演化。随着病毒在早期阶段快速扩散,它们累积了许多突变,其中有不少可以影响蛋白质功能。去年的测序研究表明,这些突变大多对病毒是有害的,但当时疫情持续的时间还不长,不足以通过自然选择将其清除。


现在研究人员看到,许多突变并没有存留多久,病毒的基因组变化速度符合人们的预期。“这一次埃博拉在人类中传播得最久规模也最大,它已经开始清除对自己不利的突变了,” Park说。


这项研究还证实了人们的一些其他推测,比如说有患者体内出现了人类酶编辑病毒基因组的现象。这是首次在埃博拉中发现这类事件,该事件一般只出现在和人类长期互作的病毒中。


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