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SaferGene 首推Uni-DMX ,使Illumina Xten全基因组数据生产时间缩短至1小时

2015年6月15日,专注为基因组分析提供硬件及软件一体化私有云计算解决方案的新兴公司 SaferGene 宣布,推出全球第一款基因数据生产提速产品Uni-DMX,该产品可同时支持10台Xten或30台Hiseq2500的数据生产需求,同时计划在下个月推出全新的全基因组分析解决方案,帮助企业与科研机构安全、快速、自动便捷地完成基因组分析,新方案将显着降低IT与人工成本。

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据BBC Research的数据显示,全球基因测序市场总量从2011年的20亿美元增长至2018年的117亿美元,复合年均增长率达21.2%。目前基因数据的生产相对简单,但是对基因组数据的安全、存储、计算及分析已成为该领域最主要的瓶颈。目前基因测序数据分析市场的复合年均增长率为23%,2018年将达到35亿美金。SaferGene的Uni-DMX产品将有效提升当前基因数据分析效率。


Uni-DMX能将 Illumina 测序仪产生的 BCL 文件快速转化为 fastq 文件,整个过程不到1个小时,而目前普通的 HPC 构架在 Xten 上整个数据生产时间为4-5个小时。Uni-DMX 是基于Illumina BCL2fastq 软件的二次开发,利用 CUDA GPU 加速技术,做到一小时内完成 BCL 到 fastq 的转化。这样,只需1台GPU高性能服务器就可同时支持10台Xten或者25台Hiseq2500产生的 BCL 文件。同时也支持 Illumina 最新推出的 HiSeq X Five、HiSeq 3000、HiSeq 4000,以及 NextSeq 550 系统。


此外, Uni-DMX 将无缝集成 SaferGene 即将推出的 Gene-Spark 全基因组分析平台,实现1个小时完成人类全基因组分析。


关于SaferGene


SaferGene 将专注于为基因组分析提供大数据分析平台及技术支持。服务包括数据存储与安全,计算软硬件加速,临床文献数据挖掘,自动化报告。


SaferGene 团队早在2012年就基于hadoop 1.0成功开发全外显子组测序分析平台,并大规模应用于企业内部,2014年10月SaferGene在全球率先研发出基于Illumina Xten全基因组全套解决方案,并使全基因组分析时间缩短为1小时。


目前这套系统已经稳定运行一年左右,分析近万个人类全基因组。为了更好地为企业及科研单位提供一个稳定、安全、便捷的基因组分析平台,提高分析质量,满足客户定制化需求,SaferGene决定于2015年6月正式开始商业化运作。


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