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东亚的地方流行的结核菌株

科研人员报告说,一个结核菌家族可能起源于东南亚,并且随着汉族人口的扩张而同时扩张。

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结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)菌株北京家族被认为造成了全球结核病流行的1/4以上,但是人们对这个家族的起源和多样性的了解不多。Qian Gao及其同事对来自该细菌家族地方流行的中国的95个代表性北京家族菌株的全基因组进行了测序。


这组作者把这些基因组与此前公布的来自15个国家的263个北京菌株的基因组结合起来,重建了这个家族的进化历史。通过比较菌株的地理分布与它们的进化亲缘关系,这组作者识别出了东亚南部是这个北京家族菌株的最可能的起源地点。


这组作者估计,这个家族在大约3万年前出现,那时候现代人被认为已经到达了东亚,然后与人类人口的扩张同时扩张。在北京家族内部,被称为“现代”北京菌株的亚型占主流地位。


这组作者发现,这个亚型在大约6000到7000年前在中国北方迅速扩展,这恰逢汉族人口在这个区域的扩张。这组作者说,现代北京菌株的主流地位可能是由于高毒力,这可能是对古代汉族人口密度的增加做出反应而进化出来的。

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