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惊现世界首篇千人作者基因组学论文

尽管在许多科学领域论文作者的列表一直在不断地拉长,但是当一篇注明1,000多名作者的果蝇基因组学论文发表之时,它引发了网上关于作者身份意义的激烈讨论。这篇发表在《G3: Genes Genomes Genetics》杂志上的论文署名了1,014位作者——其中900多人是大学生。


德克萨斯大学泛美分校无脊椎动物神经行为学家Zen Faulkes,在他的博客(blog)上提出质疑,是否每个人都对论文做出了的足够的贡献,而被冠以作者头衔。


但论文的资深作者、华盛顿大学遗传学家Sarah Elgin说,大型合作有着相应很大的作者列表已经变为了基因组学研究中无可争辩的事实。“集合许多人的努力可以让你做好研究项目,”她说。


在诸如粒子物理学一类的领域四位数的作者列表很平常,但这在生物学领域却非常罕见。这篇G3论文着重测序了果蝇基因组中称作为Muller F元件的一个特殊的区段。作者们是基因组学教育合作组织(Genomics Education Partnership)的成员,他们手动纠正了序列草图中的一些错误,并注释了来自4个果蝇物种基因组的这一区段。结果表明,在4000万年的进化过程中Muller F元件(也称作为点状染色体(dot chromosome))的一些关键部分一直保守存在于果蝇物种中。


英国曼彻斯特大学遗传学家和果蝇研究人员Andreas Prokop(非论文的作者),在他的推特(tweet)上表示了对这一研究项目的支持:他写道利用900名大学生的力量来编辑高度重复的DNA序列——这是科学与教育一次独特的融合。


有人则对此感到震惊。威斯康星大学麦迪逊分校合成生物学家William Alexander在推特上写道,这篇G3论文居然有1000多名作者,真是让我目瞪口呆。并且第一作者是如何占到那个位置的?


Faulkes在他的博客中写道:“像这样的论文呈现了一个观点:科学论文的‘作者身份’是毫无意义的。”他认为,这些学生可以被称作是贡献者,他们的名字应该列入在一份补充文件中。


在采访中,Faulkes说他认为根据国际医学期刊编辑委员会的定义,这些学生们不符合作者资格。此外,这些指导准则还要求作者要负责“起草论文或是出于重要的知识内容对论文进行细致地修改”。


Elgin说,所有的学生阅读、评论和批准了论文稿,但确实没有撰写或是修改它。纠正和注释序列需要进行大量的数据分析,每个学生都对这一项目做出了“重大的知识贡献”,因此在作者列表中占据了一席之地。


G3出版商美国遗传学会博客——Genes to Genomes的一篇博文,引用了Elgin所说的一段话,“我们的目标之一就是要发表一篇以学生作为共同作者的论文。我们希望他们都能在看到自己的名字登上PubMed!”


美国遗传学会执行董事Adam Fagen熟知这篇论文,他表示一个大型的研究团队投入这篇论文处理了巨大量的研究数据。作者列表的开头和末尾出现的都是关键作者,其他一些人是根据研究机构按字母顺序进行排列。论文的第一作者、华盛顿大学遗传学家Wilson Leung领导了对最终数据的统计学分析。


在线讨论强调了为何在科学学科之间作者的定义会有差异,这取决于涉及的研究类型:例如ENCODE一类的大型遗传学项目包含数百个合作研究人员(延伸阅读:Nature等十多篇文章公布小鼠ENCODE重大成果 )。Faulkes从事甲壳类动物生物学研究,他说在他的研究领域很少有论文有十个或以上的作者。但是在博客中他指出,2012年发表在《Physics Letters B》杂志上的一篇关于希格斯玻色子的里程碑论文列明了2,932位作者。这篇Physics Letters B论文的作者之一,华盛顿大学的粒子物理学家Gordon Watts说:“我们有着悠久的长作者列表传统,我们都知道如何解释它们。在粒子物理学中,都是非常大型的实验,人们承担着许多不同的任务。”


在他的一篇博客文章中,Faulkes提出了一种新规则:“如果你论文的作者数量达到千名,你在论文上所署之名将不能够实现任期或晋升的目的。”


原文链接:Drosophila Muller F Elements Maintain a Distinct Set of Genomic Properties Over 40 Million Years of Evolution


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