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基因测序技术侦破“跨国腹泻案”

英国疾控部门一个快速反应小组近日发表论文,还原了他们怎样利用全基因组测序和食品溯源技术,将一场跨国暴发的肠炎沙门氏菌疫情追溯到德国的一家禽蛋生产商。


这次疫情最初发生在2014年5月~9月之间,涉及英国中部、西北部和南部的至少287个病例。同时,肠炎沙门氏菌疫情也在法国和奥地利出现。这三国样本中得到的分离菌经过多位点可变数目串联重复序列分析((MLVA)后,发现属同一种。此后,相似病例出现在卢森堡和德国。


法国疫情最先被溯源到一家德国禽蛋生产商。进一步的溯源调查也显示,其他疫情也同这家生产商有关。在这些国家的分离菌样本都做了全基因组测序后,这一结论得到确认。


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