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把微生物组样本与人类来源联系起来

科研人员报告了用于识别人类微生物组样本的独特而稳定的元基因组编码。

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血型和基因组变异一直被用于在法医鉴定、家谱和灾难响应中鉴别个体,但是微生物组——见于每个人的微生物的构成的补体——迄今为止没能提供独特的识别特征,出现这种情况的原因部分是由于缺乏人群中的个体微生物组的可靠、稳定而独特的编码。


Curtis Huttenhower 及其同事开发了一种算法,从而根据身体不同部位的微生物物种和基因,建立元基因组编码,并把这种算法应用到了来自人类微生物组工程招募的120人的样本上。


人类微生物组工程是一个研究人类微生物组的政府资助的协作体。这组作者仅仅根据身体部位特异性微生物组编码,就从许多人中间准确分辨出了个体的微生物组。


当对每个受试者首次访问的30到300天后收集的样本重复这一分析的时候,使用同样的编码可以一对一地识别出大约30%的样本,几乎没有假阳性;在至多一年之后,使用大便样本的重复分析正确识别出了大约80%的微生物组,这提示了来自肠道微生物组的编码具有相对的稳定性。


这组作者说,由于微生物组库的相当一部分样本可能有潜力在数据库中被一对一地识别出来,其中某些样本可能含有敏感的个人信息,因此不能假定这类样本具有完全的匿名性。


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