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Nature:清华大学生命学院朱听课题组在发表空气微生物宏基因组测序新技术

生命学院朱听课题组于2015年4月23日在Nature Protocols在线发表了题为Optimized DNA extraction and metagenomic sequencing of airborne microbial communities(空气微生物DNA提取及宏基因组测序方法)的论文,报道空气微生物宏基因组测序新技术。


大气生物圈是一个与其它环境生物圈密切相关,且与人类呼吸系统及皮肤直接作用的重要生物圈。目前DNA测序和宏基因组学方法虽已被广泛用于其它环境微生物研究,但将其应用于空气微生物的研究一直存在样品DNA含量少,传统方法难以获得足够DNA进行测序等技术困难。朱听课题组建立了一套从空气颗粒物样品中提取、纯化DNA、测序及宏基因组学分析的技术。这套新技术的建立使得对空气微生物的全面宏基因组研究成为可能,也为其它环境微生物研究提供了一种通用方法。因此,该技术的实验方法被约稿在Nature Protocols上进行了详细报道。


朱听课题组的主要科研方向是研究、开发与核酸相关的生物新技术。自2012年初建立,朱听课题组开始进入环境微生物领域,重点开展针对空气微生物宏基因组测序技术的研究,2014年1月即在权威环境科学杂志ES&T发表了题为Inhalable microorganisms in Beijing’s PM2.5 and PM10 pollutants during a severe smog event的研究论文,首次完成对空气微生物的宏基因组测序,并在“种”的水平上鉴别空气中复杂的微生物组分。此项研究结果及其使用的新技术得到了包括Nature, Scientific American, Los Angeles Times, 参考消息、科技日报、北京日报等国内外学术、社会媒体的广泛报道,同时也使关于大气生物圈的研究逐渐成为环境微生物学的一个新兴领域。


本文第一作者为生命科学学院2012级博士研究生姜文君,第二作者为PTN 2012级博士研究生梁鹏。本课题与清华大学环境学院蒋靖坤课题组合作完成,并得到科技部、国家自然科学基金委、清华-北大生命科学联合中心、感染性疾病诊治协同创新中心的经费支持。

Nature:清华大学生命学院朱听课题组在发表空气微生物宏基因组测序新技术.jpg

空气微生物宏基因组测序技术示意图


原文链接:Optimized DNA extraction and metagenomic sequencing of airborne microbial communities


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