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Nature:教你识别“骗子”细胞系

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在世界各地的实验室中许多的细胞系被误贴标签或是遭到污染,但是科学家们却很少会去检查核实他们细胞的真实身份。


为了鼓励科学家们去鉴定细胞,来自美国基因泰克 (Genentech) 公司的研究人员说,他们创造了一种更快速、廉价的方法鉴别细胞系,并建立了一个改进了的可靠细胞系列表。这项研究工作发布在4月15日的《自然》(Nature)杂志上。此外,Nature的编辑在一篇附随通告中也表示将努力督促向Nature研究期刊提交论文的作者们验证他们的细胞系。


本周华盛顿的一个非盈利组织全球生物标准研究所(Global Biological Standards Institute)也启动了一项社会媒体活动,广为宣传有关错误辨识细胞系的问题。


美国国立综合医学研究所所长Jon Lorsch说:“Genentech选择对此投资给出了一个明确的信号:它是一个有必要进行处理的问题。”Genentech公司癌症研究人员Richard Neve说,公司开发出这一认证系统确保了更好地追踪细胞数据。


当标签说谎时


几十年来生物学家们都知道存在细胞系污染问题:因为发生了细胞系调换或混合,或是零星的污染细胞无形之中生长速度超过了它们的邻细胞。一个标记为神经干细胞的瓶子,可以很快只装有一些癌细胞。非营利国际细胞系认证委员会(ICLAC)已经鉴别出了475个已知被错误鉴定或被其他细胞污染的细胞系。


一份2007年的生物储存库材料审核结果表明,三分之一或更多的细胞系被错误鉴定或受到污染。Lorsch估计远少于三分之一的科学家们实际上检测了他们的细胞。贴错标签的细胞系可以挫败研究人员为复制自身和其他人的研究工作所付出的努力,得出有关癌症等组织活性的错误结论。


Genentech公司的研究人员一开始清理了现有的细胞系列表。标准测试方法是借助于一些短重复DNA序列来鉴定细胞。Neve和同事们收集了来自7个数据库的细胞系的DNA图谱。通过相互参照图谱并理清命名不一致的情况,他们将收集的8,577个DNA图谱缩减至2,787个独特图谱。Neve说,公司已将数据上传至美国国家生物技术信息中心,并在努力通过非营利国际细胞系认证委员会对公众公开这些数据。


Neve研究小组还开发了一种方法通过检测DNA的单核苷酸变异来分析细胞系,这一诊断性测试可按标准测试的价格,在很短的时间内完成。Neve说所需时间大约为5.5小时,而传统的方法需要21小时。ICLAC主席Amanda Capes-Davis说,这种新方法应该也可以适用于非人类细胞系(例如来自高度亲近繁殖实验室小鼠的细胞系,用标准测试来鉴定它们是一个挑战)。


Lorsch说:“这个一个很大的进步,我们希望它将帮助改变当前的状况,说服人们他们需要更加的严谨。”


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